河北医科大学学报 ›› 2020, Vol. 41 ›› Issue (12): 1421-1427.doi: 10.3969/j.issn.1007-3205.2020.12.013
摘要: 目的 通过生物信息学鉴定结直肠癌的差异表达基因,并研究候选基因在结直肠癌中表达情况以及其病理特征和预后意义。
方法 通过分析来自GEO数据库的基因表达数据集来鉴定结直肠癌中的差异表达基因,构建蛋白互作网络,找到核心蛋白,进行基因集富集分析,明确蛋白作用通路,通过免疫组织化学检测结直肠癌组织及正常组织中核心蛋白表达水平,生存分析进一步明确核心基因与结直肠癌的预后关系。
结果 通过筛选标准鉴定出89个差异表达基因,构建蛋白互相作用网络筛选出核心基因SERPINE1,基因富集分析表明SERPINE1表达与炎症反应及血管生成有关。SERPINE1的高表达与结直肠癌的浸润深度(P=0012),淋巴结转移(P=0025),远处转移(P=0040)和TNM分期(P=0016)显著相关。生存分析显示SERPINE1的高表达与结直肠癌的整体生存期较差有关(P=0002)。
结论 SERPINE1可能是结直肠癌发展过程中的致癌基因,SERPINE1高表达是结直肠癌预后不良的因素。