河北医科大学学报 ›› 2021, Vol. 42 ›› Issue (10): 1128-1132,1148.doi: 10.3969/j.issn.1007-3205.2021.10.003
摘要: 目的 探讨阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)轻度认知功能损害阶段(amentia mild cognitive impairment,aMCI)血浆中的非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)功能失调与AD的病理生理相关性,并探讨潜在的AD生物标志物和发病机制。
方法 纳入金标准诊断的aMCI受试者5例和正常对照组(normal control,NC)5例,应用微阵列技术分析aMCI和NC血浆中长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)、微小RNA(microRNA,miRNA)和信使RNA(messenger RNA,mRNA)的表达谱,应用R软件筛选出差异表达的lncRNA、miRNA、mRNA,通过PicTar 2005、TargetScan 5.1和miRanda v5数据库对差异表达的RNA的关系进行分析,建立以上调lncRNA为中心的竞争内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络,并对其中相关差异表达的mRNA进行基因本体论功能富集和京都基因与基因组百科全书通路富集分析。
结果 在外周血浆中总共筛选出lncRNA 287个、miRNA 46个和mRNA 208个在aMCI和NC的表达差异有统计学意义(P<0.05),分别有lncRNA3个、 miRNA5个和mRNA7个参与构建了遗忘型轻度认知功能损害ceRNA调控网络。GO和KEGG结果显示差异表达mRNAs主要在RNA代谢过程、细胞质应激颗粒、转录调控因子活性等生物学过程,单纯疱疹感染通路、催产素信号通路和叶酸合成通路上显著聚集。
结论 不同的ncRNA参与AD的发病机制,构建的ceRNA网络有助于增进对AD发病分子生物学机制的认识,ncRNAs可能成为AD诊断的生物标志物和治疗干预的新靶点。